Questa linea di ricerca è incentrata su due aree tematiche principali: lo studio degli ecosistemi pelagici, svolto attraverso l’acquisizione e l’elaborazione dei dati raccolti in campo durante le campagne oceanografiche e di misura e sull’applicazione di modelli matematici che simulano le dinamiche ecosistemiche (interazione tra processi fisici e biologici a micro-, meso- e macroscala), con particolare riferimento alla produzione primaria; la seconda area tematica è costituita dallo studio e dal monitoraggio delle comunità bentoniche, con particolare riferimento alle praterie di Posidonia oceanica.